Нормальная микрофлора кожи наружного слухового прохода представлена, в основном, сапрофитными и условно-патогенными бактериями-обитателями кожи. Это Staphylicoccus epidermidis, Corynebacterium pseudodiphtheriticum и другие коринебактерии. Нормальная микрофлора также включает следующие виды грибков: Aspergillus, Alternaria, Penicillium и Candida (не albicans). При воспалительных заболеваниях наружного уха исследуют его отделяемое. Внутреннее и среднее ухо являются, с точки зрения бактериологии, стерильными областями, но могут быть инфицированы либо в ходе некоторых генерализованных, системных заболеваний, где входные ворота — это дыхательные пути, либо за счет распространения местной и микрофлоры соседних органов. Факторы, способствующие инфицированию при наружном отите (воспалительный процесс затрагивает ушную раковину и/или наружный слуховой проход): травматизация различными твердыми предметами, рожистое воспаление кожных покровов прилегающей к наружному слуховому проходу области, вызванное Streptococcus pyogenes, попадание воды в слуховой проход с мацерацией кожных покровов («отит купальщиков»), вызванный Pseudomonas aeruginosa, продолжительная местная антибиотикотерапия, способствующая развитию микозов, вызванных грибками рода Aspergillus. При остром воспалительном процессе в среднем и внутреннем ухе возбудителем может быть Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Streptococcus pyogenes, Streptococcus viridans, Streptococcus pneumoniae, а также Haemophilus influenzae, E. coli, C. diphtheriae, Bacteroides чаще всего в монокультуре. При хронически протекающей инфекции чаще обнаруживают ассоциации грамотрицательных микроорганизмов рода Proteus, Klebsiella, Enterobacter, Escherichia, Pseudomonas, Actinomyces и плесневые грибы Aspergillus, Penicillium, Mucor. Для хронического процесса также характерна смена возбудителя в динамике, элиминация одних видов под влиянием проводимого лечения и замена их другими видами, устойчивыми к применяемым препаратам. При выявлении специфических возбудителей интерпретация результатов не вызывает трудностей. В других случаях, когда процесс вызывается условно-патогенными бактериями, необходимо применение количественных критериев оценки. Сделать заключение о возможном возбудителе воспалительного процесса можно на основании преобладания в мазке нативного материала, окрашенного по Граму, вида микроба, массивности роста однотипных колоний, повторности выделения культур. При острых воспалительных процессах обычно высевают в большом количестве монокультуры микроорганизмов. Более трудна интерпретация результатов микробиологического исследования при хронических воспалительных процессах, когда выявляют ассоциации бактерий. В таких случаях важна количественная оценка роста различных видов в ассоциации. Необходимо иметь в виду, что в процессе лечения антибактериальными средствами нередко происходит замена бактериальной флоры на грибковую. При наличии клинических признаков и отсутствии роста исследование рекомендуется повторить, т. к. материал, возможно, был собран неадекватно или исследование проводилось во время приёма антибиотиков. Для постановки диагноза важен анализ качественного и количественного состава микрофлоры и их корреляция с клиническими проявлениями воспалительного процесса. Этиологически значимым является наличие микроорганизмов в титре 105 и более КОЕ/мл.